バーチャルホストごとに実行ユーザを変更できるMPMとしてperuserがあります。example.comならwwwpublicで実行、private.example.comならwwwprivareで実行といったことができます。
Gentoo Linuxの場合、Apacheにperuserを組み込むには/etc/portage/package.useを変更します。
net-www/apache threads apache2_mpms_peruser
確認してみると、SSLバーチャルホストが正常に表示されませんでした。バーチャルホストのプロセスがSegmentation faultで落ちます。ちゃんと動いてるよ！という人は教えてください＞＜
